Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGADQ13349 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGADQ13349 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGADQ13349 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms