Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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IFT88Q13099 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFT88Q13099 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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