Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms