Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX8Q06710 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms