Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VBP1P61758 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VBP1P61758 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms