Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms