Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms