Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms