Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms