Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GZMBP10144 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GZMBP10144 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GZMBP10144 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms