Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms