Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms