Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYY5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYY5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYY5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYY5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYY5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYY5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYY5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYY5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYY5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms