Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms