Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms