Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms