Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTG1Q9NSN8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms