Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms