Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms