Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms