Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms