Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEC22CQ9BRL7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms