Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2Q96Q42 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms