Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms