Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms