Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM44Q96DX7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms