Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN4Q92575 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN4Q92575 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN4Q92575 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms