Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms