Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D1Q8WV19 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms