Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms