Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms