Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms