Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms