Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms