Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms