Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms