Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIP10Q15642 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms