Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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