Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
GRIN2AQ12879 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
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