Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms