Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFIP2P53365 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms