Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5CP51148 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB5CP51148 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5CP51148 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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