Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT2P35908 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT2P35908 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms