Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECHS1P30084 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECHS1P30084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms