Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA1P29973 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms