Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSFA2P28290 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSFA2P28290 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSFA2P28290 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms