Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACADSP16219 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACADSP16219 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSP16219 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms