Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT10P13645 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT10P13645 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT10P13645 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT10P13645 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT10P13645 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT10P13645 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT10P13645 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT10P13645 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT10P13645 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms