Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms