Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX7O95931 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms